在今年的財政預算案中，政府擬將6 個種子基金未來5年未需動用的結餘會回撥至政府帳目，以應對財政赤字。 在立法會財務委員會上，6個種子基金直接動用本金應付現金流需求獲得批准。
6個種子基金包括研究基金、醫院管理局公私營協作基金、語文基金、學生活動支援基金、資歷架構基金，以及資優教育基金，其中研究基金回撥最多，佔超過400億。同來自選舉委員會的立法會議員黃錦輝和梁美芬擔憂在產學研成為香港發展重點的情況下，資金的大量回撥會影響本地創科發展。新民黨葉劉淑儀則認為研究基金回撥後對研究發展影響不大，因創科局不斷有成立創科基金支持創科發展。
黃錦輝，資料圖片
財經事務及庫務局局長許正宇回應指，當局已為種子基金預留未來5年所需開支的現金流，並會在 2028 年檢視6個種子基金的財務安排。教育局副秘書長羅嘉穎則提到，近年來研資局已成立超過20個研究計劃，可助港把握創科發展機遇。
許正宇，資料圖片
鑒於現時不少種子基金的運作模式是本金存放於外匯基金作投資，在關稅戰國際投資市場不穩定的情況下，不少議員擔心會影響到基金的投資收益。立法會議員李惟宏（金融服務界）建議基金可以按一定比例投資港股，支持香港本地資本市場的發展，亦減少風險。
李惟宏，資料圖片
至於其他的種子基金，立法會議員（選舉委員會）林筱魯和尚海龍表示當局應常作檢視，取消和合併「殭屍」項目基金，例如為應對新冠疫情而成立的防疫抗疫基金。對此，財經事務及庫務局常任秘書長(庫務)黎志華回應，會提醒各政策局檢視種子基金的效益。目前，防疫抗疫基金大部分已經回撥，只留30億作後續工作處理，工作完成後，亦會將剩餘的資金回撥。
林筱魯，資料圖片
