疫苗有效率由臨床研究得出。參與研究的人群分成兩組，一組接種疫苗（疫苗組），另一組接種沒有效力的安慰劑（安慰劑組），一段時間後分析他們的發病或感染情況，而發病或感染的定義是該研究預定的某些目標情况（例如死亡、嚴重症狀等）。
疫苗有效率的計算方法：
疫苗有效率 = (安慰劑組的發病率 - 疫苗組的發病率)/安慰劑組的發病率
如果兩組人群受感染情況無異，疫苗有效率為零。若在疫苗組一百人中有一人有目標分析的情況（例如出現既定的感染症狀），而安慰劑組中一百人有十人，疫苗有效率就該情況為90%。若在疫苗組一百人中有五人有相關情況，而安慰劑組中一百人有十人，疫苗有效率就該情況為50%。所以一般來說，有效率越高，保護力越強。
但要注意，同一疫苗在不同的時間、地點、人群進行測試；或用不同的研究方案或疾病定義；又或分析不同的目標情況（例如死亡、嚴重症狀、輕微症狀等），可得出不同結果。因而不能直接比較不同疫苗有效率的數值。
例子1 BioNTech疫苗 復必泰 有效率*
參與三期臨床研究人群為16歲或以上沒有先前感染2019冠狀病毒病跡象的人士。
在疫苗組的18,198人中，有8人出現2019冠狀病毒病症狀，在安慰劑組的18,325人中，162人出現相關症狀，得出疫苗有效率為95%。
*資料來源：2019冠狀病毒病疫苗顧問專家委員會報告2021年1月
例子2 科興疫苗 克爾來福 有效率#
一項在巴西進行的三期臨床研究(二劑相隔14日)，參與人群為約12000名醫護人員。
研究得出包括預防不同嚴重情況的疫苗有效率：
-住院、重症及死亡:100%
-有症狀並需要就醫:84%
-輕微症狀不需就醫:51%
#資料來源：2019冠狀病毒病疫苗顧問專家委員會報告2021年2月
衞生署 健康促進處
衞生署
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